I. BAN CƠ YẾU CHÍNH PHỦ

1. LÃNH ĐẠO BAN CƠ YẾU CHÍNH PHỦ

- Trưởng ban: Vũ Ngọc Thiềm

- Phó Trưởng ban: Nguyễn Đăng Lực

- Phó Trưởng ban: Nguyễn Hữu Hùng

2. CÁC ĐƠN VỊ, TỔ CHỨC TRỰC THUỘC BAN CƠ YẾU CHÍNH PHỦ

- Cục Chính trị - Tổ chức

- Cục Quản lý kỹ thuật nghiệp vụ mật mã

- Cục Cơ yếu Đảng - Chính quyền

- Cục Chứng thực số và Bảo mật thông tin

- Cục Quản lý mật mã dân sự và Kiếm định sản phẩm mật mã

- Vụ Kế hoạch - Tài chính

- Vụ Khoa học - Công nghệ

- Thanh tra Cơ yếu

- Văn phòng

3. TỔ CHỨC SỰ NGHIỆP TRỰC THUỘC

- Viện Khoa học - Công nghệ mật mã

- Học viện Kỹ thuật mật mã

- Trung tâm Công nghệ thông tin và Giám sát an ninh mạng

- Tạp chí An toàn thông tin

4. TỔ CHỨC SỰ NGHIỆP ĐẶC BIỆT TRỰC THUỘC

- M 2

- M 951

5. TỔ CHỨC TRỰC THUỘC ĐƯỢC THÀNH LẬP THEO QUY ĐỊNH CỦA PHÁP LUẬT

- Công ty TNHH MTV 129

- Pháp chế

II. CƠ YẾU CÁC BỘ, NGÀNH

1. Hệ thống tổ chức cơ yếu Quân đội nhân dân

2. Hệ thống tổ chức cơ yếu Công an nhân dân

3. Hệ thống tổ chức cơ yếu Ngoại giao

4. Hệ thống tổ chức cơ yếu trong cơ quan Đảng, cơ quan khác của Nhà nước ở Trung ương và địa phương